Ar Labklājības ministrijas 1993.gada 28.oktobra rīkojumu Nr 59 "Par Medicīniskās aprūpes un darbspējas ekspertīzes kvalitātes kontroles inspekcijas reorganizāciju" izveidota Labklājības ministrijas Farmācijas departamenta Farmācijas inspekcija. LR Ministru kabineta 1996.gada 24.decembra noteikumi Nr 466 "Valsts Farmācijas inspekcijas nolikums". Inspekcija veic farmācijas valsts uzraudzību un kontroli, lai nodrošinātu kvalitatīvu, drošu un iedarbīgu zāļu un farmaceitisko produktu ražošanu un izplatīšanu un novērstu iespējamos farmaceitiskās darbības riska faktorus